吉林省肝膽醫院病理科主要承擔包括：手術標本、內鏡組織、肝穿組織等的活體組織病理診斷工作。主要擅長消化系統，尤其是肝膽病理診斷，是吉林省唯一一家具備肝穿組織病理診斷能力的病理科。

科室現有在職人員3人，其中技術員2人，外聘專家1人。本科室分為病理診斷室、免疫組化室、組織切片室及病理取材室，科室制定了完善的管理制度，建立了病理質量管理方案，其中包括病理標本接收與核對制度、常規病理診斷制度、臨床病理聯系制度、病理技術管理規范、病理檔案管理制度、病理會診接收與查驗制度、疑難病例科內會診與討論制度。嚴格按照三級檢診、審核方案實施臨床病理診斷，確保醫療安全和病理質量。在肝膽病理診斷方面能力突出，為臨床提供可靠的病理診斷，為臨床疾病診治及推測預后提供理論支持。